Para la realización de una eficaz gestión del agua es necesario un buen mantenimiento de la infraestructura tanto de transporte, con el fin de conseguir una buena eficiencia en la conducción del agua desde los embalses de regulación hasta el usuario final (impermeabilización de balsas y conducciones, rehabilitación o sustitución de tramos de redes… ), como de desagüe, para conseguir el necesario drenaje de los campos de cultivo.

El sistema de Riegos del Alto Aragón cuenta con una red de infraestructuras, cuyo mantenimiento resulta muy oneroso para la Comunidad. Por ello la Asamblea General de la C.G.R.A.A. aprobó una normativa de reparto de las funciones de mantenimiento, de forma que la Comunidad General asume la responsabilidad de las actuaciones en: canales principales del sistema, colectores generales que dividen los sectores hidráulicos, colectores que actúan como aliviaderos de emergencia de los canales ante imprevistos, desagües que dividen comunidades de regantes y aquéllos que, por su importancia, sobrepasan las posibilidades de la Comunidad de Base que lo utiliza. El mantenimiento de la red secundaria y terciaria de acequias y desagües, es asumido como responsabilidad de cada una de las Comunidades de Base por la que discurren, previa encomienda de gestión acordada con la CHE.

En función de este reparto de responsabilidades y competencias, la C.G.R.A.A. destina una cantidad de fondos, que en los tres últimos años ascendió a una media de 1,1 M € a labores de mantenimiento de la infraestructura del sistema, distribuyéndose el gasto en las siguientes partidas: maquinaria propia, incluido personal y vehículos de apoyo, brigadas de obras formadas por personal propio, materiales, contratación de obras con empresas externas, contratación de obras indicadas por la CHE, limpieza de balsas, y vigilancia y control, todo ello supervisado por la CHE.

La CGRAA cuenta con un parque de maquinaria propia consistente actualmente en dos retroexcavadoras de orugas, una retroexcavadora de ruedas de goma, un tractor con desbrozadora acoplada y cuatro vehículos de apoyo, uno para cada máquina. Estas máquinas trabajan de forma continuada durante todo el año con planes de trabajo previamente asignados y, extraordinariamente, en roturas imprevistas con el fin de restituir el servicio lo antes posible. A la par que las máquinas excavadoras y para la realización de trabajos de obra civil como: pasos en las desembocaduras de los desagües secundarios, en las colas de acequias, la reparación de puentes etc… la C.G.R.A.A cuenta también con una pequeña brigada formada por un encargado, varios operarios, con una excavadora mixta, camión con pluma y los correspondientes vehículos de apoyo.

Una vez que se termina la campaña de riegos, se procede a realizar labores de reparación y mantenimiento en el interior de los canales en coordinación con el personal de la CHE. Una brigada actúa entre los meses de octubre y marzo estando formada por: un ingeniero técnico al cargo, un encargado de obras y dos cuadrillas formadas cada una por un jefe de equipo y siete peones. Sus principales funciones son: la reparación de fugas y grietas en taludes y soleras, la sustitución de tramos de paños y soleras deteriorados, la limpieza de sedimentos y materiales dentro de los canales, la reparación y mantenimiento de compuertas de las tomas y acondicionamiento de los viales de servicio.